ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การวิเคราะห์ความหลากหลายทางชีวภาพของยีสต์ในดินป่าดิบเขาและดินป่าสนของอุทยานแห่งชาติน้ำหนาวด้วยเทคนิค DGGE และ DHPLC

หน่วยงาน ฐานข้อมูลโครงสร้างพื้นฐานภาครัฐด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี กระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การวิเคราะห์ความหลากหลายทางชีวภาพของยีสต์ในดินป่าดิบเขาและดินป่าสนของอุทยานแห่งชาติน้ำหนาวด้วยเทคนิค DGGE และ DHPLC
นักวิจัย : ธวัชชัย สุ่มประดิษฐ์
คำค้น : DGGE , DHPLC , ความหลากหลายทางชีวภาพของยีสต์
หน่วยงาน : ฐานข้อมูลโครงสร้างพื้นฐานภาครัฐด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี กระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2551
อ้างอิง : -
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :



วิเคราะห์ความหลากหลายของยีสต์ในดินป่าดิบเขาอุทยานแห่งชาติน้ำหนาวด้วยเทคนิค denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) จากดินตัวอย่างจำนวน 12 ตัวอย่าง ที่ใช้สกัดดีเอนเอโดยตรงด้วยวิธี proteinase K/SDS ดีเอนเอที่สกัดได้นำมาทำให้บริสุทธิ์ด้วยวิธี freezing-thawing และใช้เป็น DNA template ในการทำ semi-nested PCR เพื่อเพิ่มปริมาณยีนส่วน D1/D2 domain ของ 26S rDNA ของยีสต์ ซึ่งสามารถเพิ่มปริมาณยีน D1/D2 domain จาก DNA template ของดินป่าดิบเขา 8 ตัวอย่าง เมื่อนำ GC clamp-D1 fragments ที่ได้ไปวิเคราะห์ความหลากหลายของยีสต์ในดินด้วยเทคนิค DGGE พบแถบดีเอนเอที่คาดว่าเป็นตัวแทนของเชื้อรารวมทั้งยีสต์ วิเคราะห์ความหลากหลายของยีสต์ในดินป่าสนของอุทยานแห่งชาติน้ำหนาวด้วยเทคนิค denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) โดยสกัดดีเอนเอจากดินตัวอย่างที่เก็บจากบริเวณป่าสนด้วยวิธี proteinase K/SDS ทำบริสุทธิ์ดีเอนเอที่สกัดแยกได้โดยใช้วิธี Sqeezing DNA gel และ dialysis จากผลการทดลองพบว่า วิธี Sqeezing DNA gel มีประสิทธิภาพสูงกว่า อย่างไรก็ตามจากการทดลองพบว่า ไม่สามารถเตรียม GC-clamp D1 fragments ด้วยเทคนิค semi-nested PCR ได้ จากการคัดแยกยีสต์จากดินป่าดิบเขาของอุทยานแห่งชาติน้ำหนาว โดยใช้เทคนิค enrichment ร่วมกับอาหาร acidified yeast extract malt extract พีเอช 3.7 ที่เติมคลอแรมเฟนิ-คอล 100 มิลลิกรัมต่อลิตร และกรดโพรพิโอนิก 0.1 เปอร์เซ็นต์ พบยีสต์สายพันธุ์ใหม่ 1 สปีชีส์ คือ Millerozyma phetchabunensis sp. nov. Yeast diversity in hill evergreen forest soil of Nam Nao National Park was analyzed by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). A total of 12 soil samples were applied to extract soil DNA by proteinase K/SDS method and the crude DNA was purified by freezing-thawing method. The GC clamp-D1 fragments were obtained by the semi-nested PCR technique using the purified DNA extracted from 8 soil samples as DNA template. The GC clamp-PCR products were analyzed by DGGE. A variety of DNA bands expected as the representatives of molds and yeasts inhabiting in forest soils were found on DGGE gel. Yeast diversity in pine forest soil of Nam Nao National Park was also analyzed by DGGE technique. A total of 12 soil samples were applied to extract soil DNA by proteinase K/SDS method and the crude DNA was purified by squeezing DNA gel and dialysis. However, GC-clamp D1 fragments could not be prepared by semi-nested PCR. In this study, Millerozyma phetchabunensis sp. nov. was found in the hill evergreen forest soil. This species was isolated by enrichment technique using acidified YM medium (pH 3.7) supplemented with 100 mg/L of chloramphenical and 0.1 % of propionic acid.


บรรณานุกรม :
ธวัชชัย สุ่มประดิษฐ์ . (2551). การวิเคราะห์ความหลากหลายทางชีวภาพของยีสต์ในดินป่าดิบเขาและดินป่าสนของอุทยานแห่งชาติน้ำหนาวด้วยเทคนิค DGGE และ DHPLC.
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลโครงสร้างพื้นฐานภาครัฐด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี กระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี.
ธวัชชัย สุ่มประดิษฐ์ . 2551. "การวิเคราะห์ความหลากหลายทางชีวภาพของยีสต์ในดินป่าดิบเขาและดินป่าสนของอุทยานแห่งชาติน้ำหนาวด้วยเทคนิค DGGE และ DHPLC".
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลโครงสร้างพื้นฐานภาครัฐด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี กระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี.
ธวัชชัย สุ่มประดิษฐ์ . "การวิเคราะห์ความหลากหลายทางชีวภาพของยีสต์ในดินป่าดิบเขาและดินป่าสนของอุทยานแห่งชาติน้ำหนาวด้วยเทคนิค DGGE และ DHPLC."
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลโครงสร้างพื้นฐานภาครัฐด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี กระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี, 2551. Print.
ธวัชชัย สุ่มประดิษฐ์ . การวิเคราะห์ความหลากหลายทางชีวภาพของยีสต์ในดินป่าดิบเขาและดินป่าสนของอุทยานแห่งชาติน้ำหนาวด้วยเทคนิค DGGE และ DHPLC. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลโครงสร้างพื้นฐานภาครัฐด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี กระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี; 2551.