ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Structure, dynamics and binding of drug resistance HIV-1 protease with major mutations

หน่วยงาน จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Structure, dynamics and binding of drug resistance HIV-1 protease with major mutations
นักวิจัย : Ornjira Aruksakunwong
คำค้น : Proteolytic enzymes , HIV (viruses) , Protease inhibitors , Drug resistance , Microbial mutation
หน่วยงาน : จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
ผู้ร่วมงาน : Supot Hannongbua , Pornthep Sompornpisut , Chulalongkorn University. Faculty of Science
ปีพิมพ์ : 2549
อ้างอิง : 9741429711 , http://cuir.car.chula.ac.th/handle/123456789/14375
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Thesis (Ph.D.)--Chulalongkorn University, 2006

HIV-1 protease is one of the importance targets for drug development. To date, many protease inhibitors are in clinical used, however, a major problem in the treatment of the HIV infection with protease inhibitor is the development of drug resistance. To understand the molecular basic of drug resistance, the molecular dynamic (MD) simulation of wild-type and mutant proteases complexed with inhibitors, saquinavir and ritonavir, were carried out. The protonation states of the two aspartic residues, Asp25 and Asp25', has been examined by simulating four possible protonation states, non-protonation, mono-protonation and di-protonation of the active site residues and evaluated by means of properties of structure and dynamics, quantum chemical and free energy calculations. The results lead to a conclusion that the appropriate condition is the monoprotonation on Asp25. The MD simulations of a wild-type, G48V, L90M and G48V/L90M of HIV-1 protese with saquinavir and those of a wild-type, V82F, I84V, V82F/I84V of HIV-1 protease with ritonavir have been carried out. It was found that the double mutation of both complexes has the largest impact on the bindings. The conformation changes in double mutant complexes consequently reduce the interaction between drug and protease. The results for both WT and mutants are in a good agreement with the experimental inhibition constant and the resistance fold. Fundamental understanding of the above properties is known to be a prerequisite for the structure-based drug screening and design, both for wild and mutant types.

บรรณานุกรม :
Ornjira Aruksakunwong . (2549). Structure, dynamics and binding of drug resistance HIV-1 protease with major mutations.
    กรุงเทพมหานคร : จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย.
Ornjira Aruksakunwong . 2549. "Structure, dynamics and binding of drug resistance HIV-1 protease with major mutations".
    กรุงเทพมหานคร : จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย.
Ornjira Aruksakunwong . "Structure, dynamics and binding of drug resistance HIV-1 protease with major mutations."
    กรุงเทพมหานคร : จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย, 2549. Print.
Ornjira Aruksakunwong . Structure, dynamics and binding of drug resistance HIV-1 protease with major mutations. กรุงเทพมหานคร : จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย; 2549.