ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Validation of Reference Genes for Real-Time PCR of Reproductive System in the Black Tiger Shrimp

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Validation of Reference Genes for Real-Time PCR of Reproductive System in the Black Tiger Shrimp
นักวิจัย : Rungnapa Leelatanawit , Amornpan Klanchui , Umaporn Uawisetwathana , Nitsara Karoonuthaisiri
คำค้น : animal tissue , Animals , article , beta actin , beta actin gene , Bioinformatics , controlled study , Decapoda (Crustacea) , Dmc1 gene , EF1 alpha gene , elongation factor 1alpha , Essential , female , GAPDH gene , Gene expression , gene expression profiling , Gene Expression Regulation , Genes , Genetic stability , genital system , glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase , housekeeping gene , male , nonhuman , Nucleotide sequence , ovary , Penaeus monodon , Quantitative analysis , real time polymerase chain reaction , Real-Time Polymerase Chain Reaction , Reproducibility of Results , Reproduction , RNA 18S , RNA 18s gene , testis , validation process , Vitellogenin , Vitellogenin gene , สาขาวิทยาศาสตร์เคมีและเภสัช
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2556
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/24700
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Gene expression of reproductive system of the black tiger shrimp (Peneaus monodon) has been widely studied to address poor maturation problem in captivity. However, a systematic evaluation of reference genes in quantitative real-time PCR (qPCR) for P. monodon reproductive organs is lacking. In this study, the stability of four potential reference genes (18s rRNA, GAPDH, β-actin, and EF1-α) was examined in the reproductive tissues in various conditions using bioinformatic tools: NormFinder and geNorm. For NormFinder, EF1-α and GAPDH ranked first and second as the most stable genes in testis groups whereas GAPDH and EF1-α were for ovaries from wild-caught broodstock and domesticated groups. EF1-α and β-actin ranked first and second for the eyestalk ablated ovaries. For geNorm, EF1-α and GAPDH had the best stability in all testis and ovaries from domesticated groups whereas EF1-α and β-actin were the best for ovaries from wild-caught and eyestalk ablated groups. Moreover, the expression levels of two well-known reproductive genes, Dmc1 and Vitellogenin, were used to validate these reference genes. When normalized to EF1-α, the expected expression patterns were obtained in all cases. Therefore, this work suggests that EF1-α is more versatile as reference genes in qPCR analysis for reproductive system in P. monodon. © 2012 Leelatanawit et al.

บรรณานุกรม :
Rungnapa Leelatanawit , Amornpan Klanchui , Umaporn Uawisetwathana , Nitsara Karoonuthaisiri . (2556). Validation of Reference Genes for Real-Time PCR of Reproductive System in the Black Tiger Shrimp.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Rungnapa Leelatanawit , Amornpan Klanchui , Umaporn Uawisetwathana , Nitsara Karoonuthaisiri . 2556. "Validation of Reference Genes for Real-Time PCR of Reproductive System in the Black Tiger Shrimp".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Rungnapa Leelatanawit , Amornpan Klanchui , Umaporn Uawisetwathana , Nitsara Karoonuthaisiri . "Validation of Reference Genes for Real-Time PCR of Reproductive System in the Black Tiger Shrimp."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2556. Print.
Rungnapa Leelatanawit , Amornpan Klanchui , Umaporn Uawisetwathana , Nitsara Karoonuthaisiri . Validation of Reference Genes for Real-Time PCR of Reproductive System in the Black Tiger Shrimp. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2556.