ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Diversity of type I polyketide synthase genes in the wood-decay fungus Xylaria sp. BCC 1067

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ


ชื่อเรื่อง : Diversity of type I polyketide synthase genes in the wood-decay fungus Xylaria sp. BCC 1067
นักวิจัย : Alongkorn Amnuaykanjanasin , Juntira Punya , Porntip Paungmoung , Amporn Rungrod , Anuwat Tachaleat , Somchai Pongpattanakitshote , Supapon Cheevadhanarak , Morakot Tanticharoen , พรทิพย์ ผึ้งม่วง , อัมพร หรั่งรอด , อนุวัฒน์ เตชะฤทธิ์ , สมชาย พงศ์พัฒนกิจโชติ , อลงกรณ์ อำนวยกาญจนสิน , จันทิรา ปัญญา , สุภาภรณ์ ชีวธนรักษ์ , มรกต ตันติเจริญ
คำค้น : Degenerate PCR primer , Fungi , Molecular genetics , PKS , Polyketide , Type I polyketide synthase , Xylaria , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2548
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/14491
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Fungal type I polyketide (PK) compounds are highly valuable for medical treatment and extremely diverse in structure, partly because of the enzymatic activities of reducing domains in polyketide synthases (PKSs). We have cloned several PKS genes from the fungus Xylaria sp. BCC 1067, which produces two polyketides: depudecin (reduced PK) and 19,20-epoxycytochalasin Q (PK-nonribosomal peptide (NRP) hybrid). Two new degenerate primer sets, KA-series and XKS, were designed to amplify reducing PKS and PKS-NRP synthetase hybrid genes, respectively. Five putative PKS genes were amplified in Xylaria using KA-series primers and two more with the XKS primers. All seven are predicted to encode proteins homologous to highly reduced (HR)-type PKSs. Previously designed primers in LC-, KS-, and MT-series identified four additional PKS gene fragments. Selected PKS fragments were used as probes to identify PKS genes from the genomic library of this fungus. Full-length sequences for five PKS genes were obtained: pks12, pks3, pksKA1, pksMT, and pksX1. They are structurally diverse with 1-9 putative introns and products ranging from 2162 to 3654 amino acids in length. The finding of 11 distinct PKS genes solely by means of PCR cloning supports that PKS genes are highly diverse in fungi. It also indicates that our KA-series primers can serve as powerful tools to reveal the genetic potential of fungi in production of multiple types of HR PKs, which the conventional compound screening could underestimate.

บรรณานุกรม :