ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Genetic structure of Thai rice and rice accessions obtained from the International Rice Research Institute

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Genetic structure of Thai rice and rice accessions obtained from the International Rice Research Institute
นักวิจัย : Sriprapai Chakhonkaen , Keasinee Pitnjam , Wachira Saisuk , Kittipat Ukoskit , Amorntip Muangprom , กิตติพัฒน์ อุโฆษกิจ , อมรทิพย์ เมืองพรหม
คำค้น : Biological sciences , Genetic diversity , Germplasm evaluation , Germplasm resources , InDel marker , Oryza sativa , Plant biotechnology , Plant biotechnology and related agricultural science , Population structure , Temperature sensitive genetic male-sterile , Thailand , ข้าว , ทางหลากหลายทางชีวภาพ , สาขาเกษตรศาสตร์และชีววิทยา , เชื้อพันธุ์ , ไทย
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2555
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/23641
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Background: Although the genetic structure of rice germplasm has been characterized worldwide, few studies investigated germplasm from Thailand, the world’s largest exporter of rice. Thailand and the International Rice Research Institute (IRRI) have diverse collections of rice germplasm, which could be used to develop breeding lines with desirable traits. This study aimed to investigate the level of genetic diversity and structures of Thai and selected IRRI germplasm. Understanding the genetic structure and relationships among these germplasm will be useful for parent selection used in rice breeding programs. Results: From the 98 InDel markers tested for single copy and polymorphism, 19 markers were used to evaluate 43 Thai and 57 IRRI germplasm, including improved cultivars, breeding lines, landraces, and 5 other Oryza species. The Thai accessions were selected from all rice ecologies such as irrigated, deep water, upland, and rainfed lowland ecosystems. The IRRI accessions were groups of germplasm having agronomic desirable traits, including temperature-sensitive genetic male sterility (TGMS), new plant type, early flowering, and biotic and abiotic stress resistances. Most of the InDel markers were genes with diverse functions. These markers produced the total of 127 alleles for all loci, with a mean of 6.68 alleles per locus, and a mean Polymorphic Information Content (PIC) of 0.440. Genetic diversity of Thai rice were 0.3665, 0.4479 and 0.3972 for improved cultivars, breeding lines, and landraces, respectively, while genetic diversity of IRRI improved and breeding lines were 0.3272 and 0.2970, respectively. Cluster, structure, and differentiation analyses showed six distinct groups: japonica, TGMS, deep-water, IRRI germplasm, Thai landraces and breeding lines, and other Oryza species. Conclusions: Thai and IRRI germplasm were significantly different. Thus, they can be used to broaden the genetic base and trait improvements. Cluster, structure, and differentiation analyses showed concordant results having six distinct groups, in agreement with their development, and ecologies.

บรรณานุกรม :
Sriprapai Chakhonkaen , Keasinee Pitnjam , Wachira Saisuk , Kittipat Ukoskit , Amorntip Muangprom , กิตติพัฒน์ อุโฆษกิจ , อมรทิพย์ เมืองพรหม . (2555). Genetic structure of Thai rice and rice accessions obtained from the International Rice Research Institute.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Sriprapai Chakhonkaen , Keasinee Pitnjam , Wachira Saisuk , Kittipat Ukoskit , Amorntip Muangprom , กิตติพัฒน์ อุโฆษกิจ , อมรทิพย์ เมืองพรหม . 2555. "Genetic structure of Thai rice and rice accessions obtained from the International Rice Research Institute".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Sriprapai Chakhonkaen , Keasinee Pitnjam , Wachira Saisuk , Kittipat Ukoskit , Amorntip Muangprom , กิตติพัฒน์ อุโฆษกิจ , อมรทิพย์ เมืองพรหม . "Genetic structure of Thai rice and rice accessions obtained from the International Rice Research Institute."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2555. Print.
Sriprapai Chakhonkaen , Keasinee Pitnjam , Wachira Saisuk , Kittipat Ukoskit , Amorntip Muangprom , กิตติพัฒน์ อุโฆษกิจ , อมรทิพย์ เมืองพรหม . Genetic structure of Thai rice and rice accessions obtained from the International Rice Research Institute. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2555.