ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

ผลของอุณหภูมิต่อกลไกการสังเคราะห์ mRNA ที่มีขนาดแตกต่างกันของยีน ~idesA~i ใน ~iSpirulina platenis~i สายพันธุ์ C1

หน่วยงาน ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : ผลของอุณหภูมิต่อกลไกการสังเคราะห์ mRNA ที่มีขนาดแตกต่างกันของยีน ~idesA~i ใน ~iSpirulina platenis~i สายพันธุ์ C1
นักวิจัย : สุธาดา มุ่งภักดี
คำค้น : ~iSpirulina platensis , ~i ยีน ~idesA , ~i non coding region , บริเวณ upstream และ downstream , transcription termination , repetitive DNA sequence , protective barrier , เอนไซม์ ribonuclease , ~iSpirulina platensis~i , ~idesA~i GENE , TEMPERATURE REGULATION , TRANSCRIPTION TERMINATION , REPETITIVE DNA SEQUENCE , RIBONUCLEASE ENZYME
หน่วยงาน : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2544
อ้างอิง : http://www.thaithesis.org/detail.php?id=1412
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

จากการศึกษาที่ผ่านมาพบว่ายีน ~idesA~i ซึ่งถอดรหัสให้เอนไซม์ (+,D)12 desaturase ใน ~iSpirulina platensis สายพันธุ์ C1 สร้าง mRNA 2 ชนิด คือ 1.5 และ 1.7 kb โดยระดับของ mRNA ขนาด 1.5 kb ไม่เปลี่ยนแปลงตามอุณหภูมิ ในขณะที่ mRNA ขนาด 1.7 kb เพิ่มขึ้น 2.5 เท่า เมื่อเซลล์ expose ต่ออุณหภูมิต่ำ (22(+,ฐ)C) เพื่อให้เกิดความเข้าใจมากขึ้นถึงกลไกที่เกี่ยวข้อง วิทยานิพนธ์นี้ ได้ศึกษาผลของอุณหภูมิต่อการสังเคราะห์ mRNA ที่มีขนาดแตกต่างกันของยีน ~idesA~i ผลการทดลองพบว่า เมื่อวิเคราะห์หา copy number และ แบบแผนการแสดงออกของยีนด้วย วิธี Southern blot analysis และ Northern blot analysis โดยใช้ probe ที่ออก แบบมาจากบริเวณแตกต่างกันของยีน รวมทั้งส่วนของ non coding region พบว่า mRNA ทั้งสองถูกสังเคราะห์มาจากยีนเดียวกัน และเมื่อวิเคราะห์ลำดับเบสบริเวณ upstream ของ mRNA ทั้งสอง พบว่ามีปลาย 5(+,ข) ที่ตำแหน่งเดียวกัน ซึ่งอาจถูกควบคุมด้วย promoter เดียวกันที่มีการแสดงออกอย่างต่อเนื่อง ดังนั้นการเพิ่มขึ้นของ 1.7-kb mRNA ที่อุณหภูมิต่ำไม่ได้เป็นผลเนื่องจากการควบคุมของ promoter ที่แตกต่างกัน และ เมื่อวิเคราะห์ตำแหน่งปลาย 3(+,ข) ของ mRNA ทั้งสองด้วยวิธี S1 nuclease assay พบ ว่ามีตำแหน่งแตกต่างกัน โดย mRNA ขนาด 1.5 kb มีปลาย 3(+,ข) อยู่ที่ 1,175 bp ส่วน 1.7-kb mRNA อยู่ที่ 1,455 bp โดย mRNA ขนาด 1.5 kb มีส่วนที่เป็น repetitive (RP) sequence จำนวน 1 ชุดในขณะที่ 1.7-kb mRNA ครอบคลุม RP sequence จำนวน 3 ชุด จากการวิเคราะห์ผลของอุณหภูมิต่อความคงตัวของ mRNA ด้วยวิธี RNase protection assay พบว่า โครงสร้างทุติยภูมิที่เกิดขึ้นที่ปลายด้าน 3(,ข) ของ 1.5 kb มีความ คงตัวมากกว่าของ 1.7-kb mRNA และการลดลงของอุณหภูมิไม่มีผลต่อความคงตัวของ mRNA ชนิดนี้ ส่วน mRNA ขนาด 1.7 kb ที่อุณหภูมิต่ำ พบว่าการลดลงของอุณหภูมิทำให้ ความคงตัวเพิ่มขึ้น เนื่องจากการทำงานที่ลดลงของเอนไซม์ ribonuclease และยังพบ อีกว่าโครงสร้างของ stem loop ของ 1.7-kb mRNA มีผลต่อการเข้าจับของ cellular factor บางตัวซึ่งสามารถส่งเสริมการเป็น protective barrier ของโครงสร้าง loop ในการป้องกันการทำงานของเอนไซม์ exoribonuclease ดังนั้นจึงเห็นการเพิ่มขึ้นของ 1.7-kb mRNA ที่อุณหภูมิ 22(+,ฐ)C และจากผลการตรวจสอบอัตราการสลายตัวของ mRNA ทั้งสองใน ~iin vivo~i พบว่า mRNA ขนาด 1.5 kb ไม่ได้เกิดจากการ processing ของ mRNA ขนาด 1.7 kb ดังนั้น สิ่งที่เป็นตัวควบคุมการแสดงออกที่แตกต่างกันของ mRNA ทั้งสองคือ การ terminator และเสถียรภาพของ mRNA กล่าวคือ 1.5 kb และ 1.7 kb ถูกสร้างด้วย promoter ชนิดเดียวกัน แต่ terminate ในตำแหน่งที่แตกต่างกัน โครง สร้างของ 1.5-kb mRNA ซึ่งมีเพียง 1 ชุด ของ RP sequence เป็นโครงสร้างที่เสถียร และไม่ขึ้นอยู่กับอุณหภูมิ ส่วน 1.7-kb mRNA ซึ่งมี 3 ชุด ของ RP sequence มี ความไม่เสถียรที่อุณหภูมิ 35(+,ฐ)C และเมื่อลดอุณหภูมิเป็น 22(+,ฐ)C พบว่ามี เสถียรภาพมากขึ้น เนื่องจากมีโปรตีนที่ถูกชักนำให้สร้างที่ 22(+,ฐ)C เข้าป้องกัน mRNA จากการถูกทำลายด้วย exoribonuclease แสดงให้เห็นว่า mRNA ขนาด 1.7 kb อาจ เกี่ยวข้องกับการปรับตัวของเซลล์ที่อุณหภูมิต่ำ

บรรณานุกรม :
สุธาดา มุ่งภักดี . (2544). ผลของอุณหภูมิต่อกลไกการสังเคราะห์ mRNA ที่มีขนาดแตกต่างกันของยีน ~idesA~i ใน ~iSpirulina platenis~i สายพันธุ์ C1.
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
สุธาดา มุ่งภักดี . 2544. "ผลของอุณหภูมิต่อกลไกการสังเคราะห์ mRNA ที่มีขนาดแตกต่างกันของยีน ~idesA~i ใน ~iSpirulina platenis~i สายพันธุ์ C1".
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย.
สุธาดา มุ่งภักดี . "ผลของอุณหภูมิต่อกลไกการสังเคราะห์ mRNA ที่มีขนาดแตกต่างกันของยีน ~idesA~i ใน ~iSpirulina platenis~i สายพันธุ์ C1."
    กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย, 2544. Print.
สุธาดา มุ่งภักดี . ผลของอุณหภูมิต่อกลไกการสังเคราะห์ mRNA ที่มีขนาดแตกต่างกันของยีน ~idesA~i ใน ~iSpirulina platenis~i สายพันธุ์ C1. กรุงเทพมหานคร : ฐานข้อมูลวิทยานิพนธ์ไทย; 2544.